El Instituto “Dr. Juan Bautista Alberdi” fue creado el 14 de febrero de 1995, por Acuerdo General n.º2 del Superior Tribunal de Justicia. Su nombre se escogió en homenaje al jurista y estadista Dr. Juan Bautista Alberdi, autor de “Bases y Puntos de Partida de la Organización Política de la República Argentina”, obra fundacional de gran influencia en la primera Constitución Argentina, sancionada en 1853. El Instituto Alberdi fue la 5.ª Escuela Judicial del país en crearse, luego de Chaco (1978), Chubut (1991), Salta (1992) y Catamarca (1994). La institución pionera fue el Centro de Estudios Judiciales, creado en 1978 por la Dra. María Luisa Lucas.
La denominación de “Instituto” respondió a la idea de fomentar el intercambio de conocimientos y experiencias entre pares, en un ámbito participativo y colaborativo.
Depende en forma directa del Superior Tribunal de Justicia de la Provincia y tiene un órgano consultivo, que es el Consejo Académico.
Funciona en Paraná, pero sus actividades se desarrollan en todas las circunscripciones judiciales de Entre Ríos de manera presencial, vía streaming y virtual.
Desde el año 2014 se encuentra bajo la dirección de Susana Medina, Presidenta de la Sala N.º3 del Trabajo del Superior Tribunal de Justicia.